斯金納實驗系統(tǒng)的任務模式大部分建立在動物對獎賞渴望的心理因素上。進行任務前一周左右，先將動物進行饑餓處理，使動物體重控制在原有的85%-90%之間，以保證動物有動機去主動學習，完成任務。任務模式分為不同階段，可由淺入深，逐步讓動物學習。

 

　　一階段：讓動物學會如何獲得獎賞。在動機的驅使下，動物會本能的不停探索箱子內部。程序可以設置為感應到動物嘴巴靠近獎賞口時，機器自動給予一定時間或者體積的獎勵。一般三天之內，動物就可以熟練獲得獎勵（以規(guī)定時間內動物達成一定獎賞次數(shù)為標準）。

 

　　二階段：增加更多操作性行為，例如壓桿，觸屏等，使相應行為與獎賞聯(lián)系起來。例如實驗可以設計為屏幕隨機出現(xiàn)一個圖形。基于動物探索的本能，當重復之前的行為得不到獎賞后，動物會進一步探索，相較之前的箱體環(huán)境，圖形屬于新鮮元素，當動物觸摸圖形，以獎賞作為反饋激勵動物學習。實驗任務一般會在規(guī)定時間內，設置一定的trail次數(shù)，每次trail之間會設置隨機時間間隔，減少動物隨機行為對數(shù)據(jù)的干擾。依據(jù)不同實驗需求，可改變獎賞概率，任務難度等。逐步將需要付出的行為依比率增加，例如鼻觸次數(shù)，壓桿次數(shù)等。為激勵動物做出行為，可將獎賞也按照相應比率增加。

 

　　相較于常見的行為學系統(tǒng)，斯金納實驗系統(tǒng)實驗數(shù)據(jù)的評估方式更加豐富，訓練方式種類多，更有利于研究多個腦區(qū)之間的投射關系。除了依據(jù)實驗范式得到行為的判斷指標之外，通過全程的軟件數(shù)據(jù)記錄，可以分析動物任務表現(xiàn)中的注意力，動機等多種指標。